Master of Arts dalam pelayanan Pastoral Konseling bertujuan untuk mempersiapkan, mendidik, membekali mahasiswa dengan teori-teori pelayanan dan konseling pastoral serta pengembangan siklus hidup, dan mampu mengintegrasikan ajaran teologis dengan pengetahuan dan keterampilan psikologis untuk menawarkan pelayanan dan konseling pastoral dalam berbagai setting konseling pastoral. Kuliah 45 SKS akan diperuntukkan bagi siswa untuk mencapai program gelar.